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- Acceptance sampling in quality control: from theory to the web in PHP, python, and gnuplotPublication . Casquilho, Miguel; Carolino, Elisabete; Espírito Santo, André; Carvalho, Sandro; Miranda, João Luís; Bordado, João M.Quality is nowadays a ubiquitous component in manufacturing and many other activities. We present a computation related to Acceptance Sampling, which, together with Statistical Process Control, makes the fundamentals of statistical Quality Control. We provide a webpage where a user’s typical sample from a process can be inserted, leading to “accept” or “reject” vs. given specifications. We have several goals: to offer, on a webpage, the statistical procedure computation, which is otherwise complex; to combine, on a Linux platform, programming languages, PHP and Python, and a graphical utility, gnuplot; and to stress the suggestion of the Web as a computing medium. The webpage is freely accessible to a user just using a browser, i.e., installing no software, thus needing no special power or matching operating system, this being an example adaptable to many other problems. The study also draws attention both to the use of the Web for scientific computing, and to the convenience of this use in scientific publications. Web-based computing in general is advocated, this route uses the same executable programs as classical computing, which is the core technical difficulty. In our technological era, this still insufficiently explored approach is here made accessible, inviting the sharing between academia and industry.
- Improving the quality of publications in and advancing the entire paradigms of clinical and social pharmacy practice research: the Granada statementsPublication . Fernandez-Llimos, Fernando; Desselle, Shane; Stewart, Derek; Garcia-Cardenas, Victoria; Babar, Zaheer-Ud-Din; Bond, Christine; Dago, Ana; Jacobsen, Ramune; Nørgaard, Lotte Stig; Polidori, Carlo; Sanchez-Polo, Manuel; Santos-Ramos, Bernardo; Shcherbakova, Natalia; Tonin, FernandaPharmacy and pharmaceutical sciences embrace a series of different disciplines. Pharmacy practice has been defined as “the scientific discipline that studies the different aspects of the practice of pharmacy and its impact on health care systems, medicine use, and patient care”. Thus, pharmacy practice studies embrace both clinical pharmacy and social pharmacy elements. Like any other scientific discipline, clinical and social pharmacy practice disseminates research findings using scientific journals. Clinical pharmacy and social pharmacy journal editors have a role in promoting the discipline by enhancing the quality of the articles published. As has occurred in other health care areas (i.e., medicine and nursing), a group of clinical and social pharmacy practice journal editors gathered in Granada, Spain to discuss how journals could contribute to strengthening pharmacy practice as a discipline. The result of that meeting was compiled in these Granada Statements, which comprise 18 recommendations gathered into six topics: the appropriate use of terminology, impactful abstracts, the required peer reviews, journal scattering, more effective and wiser use of journal and article performance metrics, and authors’ selection of the most appropriate pharmacy practice journal to submit their work.
- Alternative sérum biomarkers of bacteraemia for intensive care unit patientsPublication . Araújo, Rúben; Von Rekowski, Cristiana; Bento, Luís; Fonseca, Tiago AH; Calado, CecíliaThe diagnosis of infections in hospital or clinical settings usually involves a series of time-consuming steps, including biological sample collection, culture growth of the organism isolation and subsequent characterization. For this, there are diverse infection biomarkers based on blood analysis, however, these are of limited use in patients presenting confound processes as inflammatory process as occurring at intensive care units. In this preliminary study, the application of serum analysis by FTIR spectroscopy, to predict bacteraemia in 102 critically ill patients in an ICU was evaluated. It was analysed the effect of spectra pre-processing methods and spectral sub-regions on t-distributed stochastic neighbour embedding. By optimizing Support Vector Machine (SVM) models, based on normalised second derivative spectra of a smaller subregion, it was possible to achieve a good bacteraemia predictive model with a sensitivity and specificity of 76%. Since FTIR spectra of serum is acquired in a simple, economic and rapid mode, the technique presents the potential to be a cost-effective methodology of bacteraemia identification, with special relevance in critically ill patients, where a rapid infection diagnostic will allow to avoid the unnecessary use of antibiotics, which ultimately will ease the load on already fragile patients' metabolism.
- A new approach for rapid detection of bioactive compounds using MIR spectroscopy and machine learning algorithmsPublication . Sampaio, P. N.; Duarte, Fernando B.; Calado, CecíliaNowadays, microbial infections and resistance to antibiotic drugs are the biggest challenges, which threaten the health of societies. Due to several pharmacological activities associated with Cynara cardunculus, such as hepatoprotective, antioxidative, anticarcinogenic, hypocholesterolemic, antibacterial, anti-HIV, among others, extracts from seeds, leaves, and flowers were tested in Escherichia coli cells. The sensibility of the Mid-infrared (MIR) spectroscopy allowed to perform a detailed analysis of the antimicrobial action of extracts in terms of their biomolecular changes. A comparative model based on several commercial antibiotics such as metronidazole, kanamycin, clarithromycin, chloramphenicol, and ampicillin, was developed. The clustering analysis was performed using unsupervised algorithms such as Principal Component Analysis (PCA), and Kohonen Self-Organizing Maps (SOM). The extracts characterized with antioxidant activity were clustered with antibiotics and presented a promissory antimicrobial activity. According to this preliminary result, it is possible to use the MIR spectroscopy and machine learning algorithm to discover promissory bio compounds characterized by antimicrobial properties, allowing to develop a platform to discover new bioactive molecules, reducing time and costs.
- Dissection of the IFN-γ versus IL-17-specific transcriptomes of γδ T cells: a new role for signaling adaptor ThemisPublication . Inácio, Daniel; Amado, Tiago; Pamplona, Ana; Sobral, Daniel; Cunha, Carolina; Lesourne, Renaud; Gomes, Anita Q.; Silva-Santos, BrunoThe crucial role of murine γδ T cells in several (patho)physiological contexts stems from a complex process of ‘developmental pre-programming’ in the thymus, after which a significant fraction of γδ T cells populate peripheral sites already endowed with the capacity to secrete either IL-17 or IFN-γ. However, despite the relevance of these γδ T cell effector subsets, we still lack knowledge on the transcriptomes that specifically associate with IL-17 or IFN-γ production. To address this, we established a double reporter IL-17-GFP:IFN-γ-YFP mouse strain, which allowed us to isolate pure peripheral IL-17-producing (γδ17) or IFN-γ-producing (γδIFN) γδ T cells to perform RNA-sequencing. This led to the identification of the distinct transcriptomes of γδ17 and γδIFN cells, which surprisingly diverged in 6337 differentially (over 1.5-fold) expressed genes. Pathway and gene ontology analyses indicated that γδ17 cells differ from γδIFN cells in their selective ability to sense and integrate external cues, whereas γδIFN stands out in replication, transcription, and translation processes. A detailed analysis of the top differentially expressed genes between γδ17 and γδIFN cells revealed that most of the signature genes of each subset increased their expression levels in the periphery (compared to the thymus), suggesting that γδ17 and γδIFN cells only terminate their differentiation process at peripheral sites. Among the top differentially expressed genes, we found Themis, a T cell-specific gene involved in the regulation of TCR signal strength, to be enriched in γδIFN cells. Importantly, we found that Themis deficiency leads to a dysregulated effector γδ T cell peripheral compartment at steady state, which upon infection with Plasmodium berguei ANKA sporozoites confers Themis-deficient mice full protection from experimental cerebral malaria, a γδIFN-dependent pathology. Accordingly, we observed a less activated and less proliferative γδIFN population in the peripheral lymph nodes of infected Themis-deficient mice compared to Themis-sufficient controls. This work demonstrates the relevance of the characterization of the γδIFN and γδ17 transcriptomes to uncover new players in the regulation of γδ T cell effector functions, which may open new avenues for their manipulation in disease settings.
- Responsabilidade social das organizações. Estudo de caso: Assembleia de Deus Pentecostal - Ministério Internacional da PazPublication . Rodrigues, Natália Vanesa Canda; Sotomayor, Ana MariaA presente dissertação de mestrado explora o conceito de responsabilidade social e a sua importância para as organizações. O objetivo deste estudo é analisar as práticas de responsabilidade social adotadas pelas organizações e a sua relação com a comunidade. A pesquisa foi conduzida através de uma revisão bibliográfica e de um estudo de caso com a Assembleia de Deus Pentecostal – Ministério Internacional da Paz. Os resultados demonstram que a organização estudada pratica ações de responsabilidade social em diferentes áreas, tais como desenvolvimento social e ambiental. Além disso, foi observado que as práticas de responsabilidade social podem ter um impacto positivo quanto à celeridade na resolução dos problemas da comunidade. Este estudo contribui para a compreensão da importância da responsabilidade social para as organizações e pode servir como referência para outras organizações interessadas em implementar práticas socialmente responsáveis.
- Effects of Quercetin in transcriptional and post-transcriptional regulation of fetal hemoglobinPublication . Canteiro, Beatriz; Mendes, Maria; Jacques, Filipa; Delgadinho, Mariana; Oliveira, Ketlyn; Ginete, Catarina; Gomes, Mário; Ribeiro, Edna; Brito, Miguel; Gomes, Anita Q.Hemoglobinopathies are a group of inherited blood disorders that primarily affect red blood cells. The most common type is known as sickle cell anemia (SCA). It is characterized by mutations in the HBB gene, which encodes the β-subunit of human hemoglobin, giving rise to hemoglobin S (HbS). When deoxygenated, HbS polymerizes in the red blood cell, giving it a sickle shape and making it rigid and fragile. Fetal hemoglobin (HbF) is the major genetic modulator of the hematologic and clinical features of sickle cell disease, an effect mediated by its exclusion from the sickle hemoglobin polymer. Fetal hemoglobin genes are genetically regulated, and the level of HbF and its distribution among sickle erythrocytes is highly variable. Currently, therapies that induce HbF are promising, such as hydroxyurea (HU). However, due to high costs for underdeveloped countries and the adverse side effects, it is important to test alternative products and develop new compounds, such as Quercetin, a natural flavonoid present in plants that has antioxidant and anti-inflammatory properties.
- As perceções de justiça organizacional no sistema de recompensas e o seu impacto na motivação dos trabalhadoresPublication . Gonçalves, Beatriz; Sotomayor, Ana MariaEste projeto aborda o tema da justiça organizacional no contexto do sistema de recompensas e o impacto da mesma na motivação dos colaboradores de instituições com objetivos e finalidades diferentes. O principal objetivo desta dissertação consiste em determinar de que forma as perceções de justiça no que concerne ao sistema de recompensas influenciam a motivação dos trabalhadores. Para tal, numa primeira fase, foi elaborada uma revisão de literatura sobre as temáticas em estudo onde a recolha de informações foi feita através de fontes secundárias, nomeadamente pesquisas bibliográficas e estudos feitos por outros investigadores. Posteriormente, foi realizado um estudo de natureza descritiva quantitativa com recurso a um questionário sobre as três temáticas referidas (perceções de justiça organizacional, sistema de recompensas e motivação), no qual participaram 203 pessoas com objetivos e áreas de trabalho diferentes para que o foco não se baseasse apenas num setor de atividade. Os resultados obtidos mostram que as recompensas monetárias são importantes no que diz respeito à motivação, mas recompensas não monetárias como, por exemplo, conciliar a vida pessoal com a profissional e o ambiente de trabalho foram também fatores que afetaram a motivação dos respondentes. A análise dos coeficientes de regressão múltipla mostrou que a justiça procedimental ou processual revelou ser um preditor significativo da motivação no trabalho. No que concerne às dimensões de justiça distributiva e justiça interacional, conclui-se que estas não têm influência sobre a motivação no trabalho.
- Avaliação das emissões de CO2 associadas ao Veículo Elétrico tendo em conta a sua integração no Sistema Elétrico PortuguêsPublication . Oliveira, Nuno Filipe Antunes de; Carvalho, Ezequiel Francisco Vale; Lagarto, João Hermínio NinitasNesta dissertação pretende-se avaliar as emissões de CO2 associadas aos veículos elétricos (VEs) tendo em conta a sua integração no sistema elétrico português (SEP). O Plano Nacional de Energia e Clima 2021-2030 (PNEC 2030), prevê que até 2030 um terço das vendas de veículos ligeiros seja elétrico. Como tal, esta tese foca-se nos impactos originados pela penetração dos VEs no SEP em 2030. Utilizou-se uma metodologia baseada num despacho económico (DE) com coordenação hidrotérmica. De forma a resolver o despacho das centrais térmicas e hídricas foi utilizado um simulador desenvolvido anteriormente em GAMS. Para avaliar os impactos resultantes da penetração dos VEs foram considerados 15 cenários que consistem em diferentes penetrações de VEs, cenários de variação dos índices de produtibilidade hídrica (IPH), de produtibilidade solar (IPS), produtibilidade eólica (IPE) e de potência instalada eólica e fotovoltaica. Os resultados dos VEs são obtidos através de uma metodologia marginal que faz a comparação entre um cenário de geração sem penetração de VEs com um cenário em que se considera a geração adicional para fornecer a carga total aos VEs. Como resultado obtém-se, através das simulações, a geração hídrica e térmica, os custos e as emissões de CO2. Concluiu-se na conclusão deste trabalho que carga adicional dos VEs consegue ser colmatada com a potência instalada prevista para 2030 e que apesar de uma maior potência renovável instalada é necessário recorrer à geração por centrais a gás. O aumento de consumo reduziu invariavelmente a bombagem das centrais com albufeira o que se verificou em vários cenários. O aumento de geração por centrais a gás aumenta as emissões do sistema o que, por conseguinte, aumenta as emissões e os custos associados aos VEs.
- Separação de lixo por processamento de imagemPublication . Bernardo, João Centúrio de Almeida; Almeida, Maria da Graça Vieira de BritoEsta dissertação tem como objetivo o desenvolvimento de uma solução para categorização e separação de resíduos urbanos, utilizando técnicas de computação e processamento de imagem. Para isso, foi necessário adquirir conhecimentos em programação Python, desenvolver um algoritmo de reconhecimento e categorização de lixo urbano e projetar um sistema físico com equipamentos que permitam a separação de resíduos urbanos, utilizando o algoritmo de categorização desenvolvido. O trabalho teve início com a realização de um estudo sobre técnicas de aquisição e processamento de imagem, seguido de uma análise da realidade portuguesa em relação à recolha de resíduos urbanos. Em seguida, foi desenvolvido um algoritmo de caracterização de símbolos, escrito em Python, utilizando a biblioteca OpenCV, e contendo um modelo de reconhecimento de imagem, o YOLO. Para este modelo ser utilizado para este propósito, teve de ser treinado com imagens categorizadas. Após treinar o modelo com um conjunto de 500 imagens com 3 categorizações (VERDE, AMARELO e AZUL), o mesmo modelo foi treinado mais duas vezes com parâmetros de treino diferentes. O algoritmo foi colocado em testes com imagens que seriam de um esquema real, e foram obtidos resultados promissores. O terceiro modelo treinado destacou-se por apresentar resultados mais consistentes, mas ainda há espaço para melhoria com o uso de uma base de dados maior. Embora o trabalho não tenha cumprido todos os objetivos, já que o objetivo do sistema físico foi abandonado, o algoritmo desenvolvido apresenta resultados promissores e pode ser utilizado em outras aplicações.