Browsing by Author "Silva, Carina"
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- Acuidade do eletrocardiograma no diagnóstico de hipertrofia ventricular esquerda em indivíduos hipertensos no distrito de PortalegrePublication . Rato, Ana; Silva, CarinaA hipertrofia ventricular esquerda (HVE) é um preditor robusto e independente de morbilidade e mortalidade cardiovascular, sendo o eletrocardiograma (ECG) a técnica mais acessível para o diagnóstico desse processo patológico. Este trabalho teve por objetivo comparar a acuidade de diagnóstico (capacidade discriminativa de um teste de diagnóistico) entre dois critérios eletrocardiográficos de HVE em indivíduos com Hipertensão Arterial (HTA): o critério de Sokolow- Lyon e o critério de Cornell. Foram analisados ecocardiogramas de 83 indivíduos hipertensos e medicados. Estimaram-se a sensibilidade e especificidade dos critérios eletrocardiográficos para homens e mulheres. A partir da metodologia Receiver Operating Characteristic (ROC) avaliou-se o desempenho do diagnóstico de HVE definido pelo critério ecocardiográfico indexado à superfície corporal (SC) (≥116g/m2 nos homens e 96g/m2 nas mulheres). Na amostra de 83 indivíduos hipertensos e medicados, a prevalência global de HVE foi de 57% (53% no sexo masculino e 60% no sexo feminino). O critério eletrocardiográfico de Sokolow-Lyon para o diagnóstico de HVE apresentou uma sensibilidade de 15% e uma especificidade 100% no sexo masculino e, uma sensibilidade de 11% e especificidade de 83% no sexo feminino. O critério de Cornell para o sexo masculino apresentou uma sensibilidade de 10% e especificidade de 94%, enquanto que no sexo feminino apresentou uma sensibilidade de 26% e uma especificidade de 83%. Relativamente ao desempenho dos dois critérios eletrocardiográficos para o diagnóstico de HVE, em termos globais, pode dizer-se que o critério de Sokolow-Lyon apresenta um desempenho superior em comparação com o critério de Cornell. Dado que os dois critérios eletrocardiográficos apresentam uma baixa sensibilidade para diagnóstico de HVE em doentes com HTA, no contexto da Avaliação de Tecnologias em Saúde (ATS) o diagnóstico de HVE em doentes hipertensos não deve ser baseado só no ECG, devem realizar-se outros exames complementares de diagnóstico.
- Alterações morfométricas na retina, coroide e nervo ótico após infeção por SARS-CoV-2Publication . Lino, Pedro; Camacho, Pedro; Mendonça, Paula; Silva, Carina; Cunha, João Paulo; Barroqueiro, Olga; Condado, P.; Nicho, I.; Carmo, R.; Castelhano, M.; Carvalho, F.; Almeida, J. C.; Prieto, I.; Poças, Ilda MariaO novo coronavírus responsável pela síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV- 2) surgiu associado à pandemia por COVID-19. A enzima conversora da angiotensina 2 (ACE-2), com aparente importância na COVID-19, pela interação com as proteínas na superfície do vírus, tem expressão em vários tecidos oculares e várias alterações como conjuntivite, uveíte, vasculite e neurite foram descritas inicialmente em modelos animais. Em estudos mais recentes, embora na maioria em doentes COVID-19 moderados/grave, tem sido descrito o comprometimento da superfície ocular anterior e do polo posterior reforçando a ideia de neurotropismo (pela facilidade de envolvimento do sistema nervoso central) que classicamente é descrito em outros coronavirus. Algumas alterações do polo posterior incluem o compromisso vascular/ isquémico tornando relevante também a observação da coroide. A SARS-CoV-2 tem sido associada à diminuição das camadas internas da retina e à presença de lesões hiperrefletivas, micro-hemorragias e manchas algodonosas. No entanto, o envolvimento da retina e a coróide em doentes previamente infetados com COVID-19 ainda não é totalmente compreendido. De forma a clarificar o envolvimento dos fatores de neuro-degeneração e vasculares, descritos em indivíduos recuperados de COVID-19 moderada/grave, é fundamental perceber que alterações existem ao nível da retina interna e da coroide, em indivíduos recuperados de COVID-19 ligeira. Questão de investigação: Existem alterações morfométricas da retina, coroide e nervo ótivo em indivíduos recuperados de COVID-19 ligeira?
- Alterações na coroide, retina e nervo ótico subsequentes a COVID-19Publication . Camacho, Pedro; Poças, Ilda Maria; Cunha, João Paulo; Silva, Carina; Ribeiro, Edna; Brito, Miguel; Mendonça, Paula; Barroqueiro, Olga; Lino, Pedro Miguel; Condado, Patrícia; Nicho, Inês; Carmo, Rita; Castelhano, Mariana; Carvalho, Francisca; Almeida, Júlio Costa; Prieto, IsabelEm março de 2022, foram registados 3413013 casos positivos (total acumulado). Conjuntivite, uveíte, vasculite, retinite e neuropatia óptica foram documentadas em modelos animais como possíveis complicações infeciosas com comportamento neurotropico semelhante ao SARS-COV. Considerando a retina uma extensão do SNC e o neurotropismo dos CoVs, a caracterização da retina, coroide e nervo ótico de pacientes infectados com COVID-19 poderá ser relevante devido a possíveis mecanismos de neurodegeneração e vascularização poderem estar envolvidos. Objetivo: Descrever as alterações que ocorrem ao nível da espessura da retina, complexo de células ganglionares, fibras nervosas peri-papilares e coróde sub-foveal em pacientes infetados por COVID-19 Vs grupo controlo.
- Alterações na retina, coróide e nervo ótico secundárias a SARS-CoVs-2Publication . Lino, Pedro Miguel; Cunha, João Paulo; Poças, Ilda Maria; Camacho, Pedro; Silva, Carina; Ribeiro, Edna; Brito, Miguel; Mendonça, Paula; Barroqueiro, Olga; Condado, Patrícia; Nicho, Inês; Carmo, Rita Barros; Castelhano, Mariana; Carvalho, Francisca; Almeida, Júlio Costa; Prieto, IsabelO novo coronavírus responsável pela síndrome respiratória aguda grave (SARSCoV- 2) surgiu associado a pandemia que hoje vivemos (COVID-19). Como para outros vírus respiratórios altamente contagiosos, as gotículas respiratórias são a principal via de transmissão do SARS-CoV-2. No entanto, outras formas de transmissão foram consideradas - filme lacrimal e saco conjuntival. O contacto próximo com indivíduos infetados e as mãos contaminadas poderão facilitar a sua transmissão mesmo em doentes que não apresentem queixas ou sintomas oculares. O olho pode ser, não só a porta de entrada dos CoVs2, mas também um dos órgãos alvo dos mesmos: conjuntivites, uveítes, vasculites, retinites, nevrites óticas. Apesar de grande parte da atenção dos estudos ser sobre o comprometimento do trato respiratório, o envolvimento da superfície ocular como a lágrima são também referidos em outros CoVs2 e a sua relação deve ser valorizada e estudada enquanto forma de contágio e transmissão. Enquanto ameaça a saúde publica em todo o mundo, a infeção por SARS-CoV-2, realça a necessidade de estudos para a caracterização e compreensão da doença mas também a transmissão de forma a adequar as respostas às necessidades de saúde inerentes. Apesar de grande parte da atenção dos estudos ser sobre o neurotropismo destes coronavírus (não só pela sua disseminação hematogénea mas também por via neuronal retrógrada) e ao possível compromisso vascular/isquémico, com as suas eventuais sequelas no SNC2-3 e envolvimento da retina humana pretendemos descrever as características tomográficas retinianas e coroideias de doentes previamente com COVID-19. Objetivo do estudo: Caracterizar diferentes métricas corio-retinianas em participantes recuperados de COVID-19 comparativamente ao grupo-controlo.
- An integrated cybernetic awareness strategy to assess cybersecurity attitudes and behaviours in school contextPublication . Antunes, Mário; Silva, Carina; Marques, FredericoDigital exposure to the Internet among the younger generations, notwithstanding their digital abilities, has increased and raised the alarm regarding the need to intensify the education on cybersecurity in schools. Understanding the human factor and its influence on children, namely their attitudes and behaviors online, is pivotal to reinforce their awareness towards cyberattacks and to promote their digital citizenship. This paper aims to present an integrated cybersecurity and cyber awareness strategy composed of three major steps: (1) Cybersecurity attitude and behavior assessment, (2) self-diagnosis, and (3) teaching/learning activities. The following contributions are made: Two questionnaires to assess risky attitudes and behaviors regarding cybersecurity; a self-diagnosis to measure students’ skills on cybersecurity; a lesson plan addressing cyber awareness to be applied on Information and Communications Technology (ICT) and citizenship education curricular units. Cybersecurity risky attitudes and behaviors were evaluated in a junior high school population of 164 students attending the sixth and ninth grades. The assessment focused on two main subjects: To identify the attitudes and behaviors that raise the risk of cybersecurity among the participating students; to characterize the acquired students’ cybersecurity and cyber awareness skills. Global and individual scores and the histograms for attitudes and behaviors are presented. The items in which we have observed significant differences between sixth and ninth grades are depicted and quantified by their corresponding p-values obtained through the Mann–Whitney non-parametric test. Regarding the results obtained on the assessment of attitudes and behaviors, although positive, we observed that the attitudes and behaviors in ninth-grade students are globally inferior compared to those attained by sixth-grade students. The deployed strategy for cyber awareness was applied in a school context; however, the same approach is suitable to be applied in other types of organizations, namely enterprises, healthcare institutions, and the public sector.
- Análise da acuidade visual no implante de LIO fáquica em miopias elevadasPublication . Santos, Vanessa; Poças, Ilda Maria; Silva, Carina; Alves, Neusa; Cardoso, AlbertoIntrodução – Na correção de miopias elevadas, a cirurgia por implante de lente intraocular fáquica tem tido progressivamente uma maior adesão em relação à cirurgia por laser. Compara-se a acuidade visual (AV) antes e após a cirurgia implanto-refrativa, verificando-se a efetividade deste método no incremento da visão em miopias elevadas. Metodologia – Foram analisados, retrospetivamente, 70 olhos de 41 pacientes, com miopia elevada, entre os 20 e 50 anos, submetidos a cirurgia implanto-refrativa entre 2009 e 2012. Resultados – Um dia após cirurgia, 42,86% da amostra melhorou a AV, 34,29% manteve e 22,85% diminuiu. Após 30 dias observou-se um aumento generalizado da quantidade de visão, sendo que: 64,29% atingiu os 10/10 de AV, 24,29% alcançou entre 9/10-7/10 e 11,42% entre 6/10-4/10. Conclusão – Comprovou-se a efetividade desta técnica cirúrgica, verificando-se o aumento da AV em 52,86% da amostra.
- Are genetic modifiers the answer to different responses to hydroxyurea treatment? A pharmacogenetic study in sickle cell anemia Angolan childrenPublication . Ginete, Catarina; Delgadinho, Mariana; Santos, Brígida; Pinto, Vera; Silva, Carina; Miranda, Armandina; Brito, MiguelSickle cell anemia (SCA) is an inherited disease affecting the hemoglobin that is particularly common in sub-Saharan Africa. Although monogenic, phenotypes are markedly heterogeneous in terms of severity and life span. Hydroxyurea is still the most common treatment for these patients, and the response to treatment is highly variable and seems to be an inherited trait. Therefore, identifying the variants that might predict hydroxyurea response is important for identifying patients who will have a poorer or non-response to treatment, and the ones that are more prone to suffer from severe side effects. In the present pharmacogenetic study, we analyzed the exons of 77 genes described in the literature as potentially associated with hydroxyurea metabolism in Angolan children treated with hydroxyurea and evaluated the drug response considering fetal hemoglobin levels, other hematological and biochemical parameters, hemolysis, number of vaso-occlusive crises and hospitalizations. Thirty variants were identified in 18 of those genes as possibly associated with drug response, five of them in gene DCHS2. Other polymorphisms in this gene were also associated with hematological, biochemical, and clinical parameters. Further research examining the maximum tolerated dose and fixed-dose with a larger sample size is necessary to corroborate these findings.
- Arrow plot and CA maps on microarray preprocessing methodsPublication . Silva, Carina; Freitas, Adelaide; Roque, Sara; Sousa, LiseteMicroarray allow to monitoring simultaneously thousands of genes, where the abundance of the transcripts under a same experimental condition at the same time can be quantified. Among various available array technologies, double channel cDNA microarray experiments have arisen in numerous technical protocols associated to genomic studies, which is the focus of this work. Microarray experiments involve many steps and each one can affect the quality of raw data. Background correction and normalization are preprocessing techniques to clean and correct the raw data when undesirable fluctuations arise from technical factors. Several recent studies showed that there is no preprocessing strategy that outperforms others in all circumstances and thus it seems difficult to provide general recommendations. In this work, it is proposed to use exploratory techniques to visualize the effects of preprocessing methods on statistical analysis of cancer two-channel microarray data sets, where the cancer types (classes) are known. For selecting differential expressed genes the arrow plot was used and the graph of profiles resultant from the correspondence analysis for visualizing the results. It was used 6 background methods and 6 normalization methods, performing 36 pre-processing methods and it was analyzed in a published cDNA microarray database (Liver) available at http://genome-www5.stanford.edu/ which microarrays were already classified by cancer type. All statistical analyses were performed using the R statistical software.
- Arrow plot and correspondence analysis maps for visualizing the effects of background correction and normalization methods on microarray dataPublication . Silva, Carina; Freitas, Adelaide; Roque, Sara; Sousa, LiseteAmong various available array technologies, double-channel cDNA microarray experiments provide numerous technical protocols associated with functional genomic studies. The chapter begins by detailing the arrow plot, which is a recent graphical-based methodology to detect differentially expressed (DE) genes, and briefly mentions the significance analysis of microarrays (SAM) procedure, which is, in contrast, quite well known. Next, it introduces the correspondence analysis (CA) and explains how the resultant graphic can be interpreted. Then, CA in both class comparison and class prediction applications and over the data sets lymphoma (lym), lung (lun), and liver (liv) is executed. The CA is applied to all three databases in order to obtain graphical representations of background correction (BC) and normalization (NM) profiles in a two-dimensional reduced space. Whenever possible, more than one preprocessing strategy on microarray data could be applied and results from preprocessed data should be compared before any conclusion and subsequent analysis.
- Arrow Plot: a new graphical tool for selecting up and down regulated genes and genes differentially expressed on samples subgroupsPublication . Silva, Carina; Turkman, Maria Antónia Amaral; Sousa, LiseteBackground: A common task in analyzing microarray data is to determine which genes are differentially expressed across two (or more) kind of tissue samples or samples submitted under experimental conditions. Several statistical methods have been proposed to accomplish this goal, generally based on measures of distance between classes. It is well known that biological samples are heterogeneous because of factors such as molecular subtypes or genetic background that are often unknown to the experimenter. For instance, in experiments which involve molecular classification of tumors it is important to identify significant subtypes of cancer. Bimodal or multimodal distributions often reflect the presence of subsamples mixtures. Consequently, there can be genes differentially expressed on sample subgroups which are missed if usual statistical approaches are used. In this paper we propose a new graphical tool which not only identifies genes with up and down regulations, but also genes with differential expression in different subclasses, that are usually missed if current statistical methods are used. This tool is based on two measures of distance between samples, namely the overlapping coefficient (OVL) between two densities and the area under the receiver operating characteristic (ROC) curve. The methodology proposed here was implemented in the open-source R software. Results: This method was applied to a publicly available dataset, as well as to a simulated dataset. We compared our results with the ones obtained using some of the standard methods for detecting differentially expressed genes, namely Welch t-statistic, fold change (FC), rank products (RP), average difference (AD), weighted average difference (WAD), moderated t-statistic (modT), intensity-based moderated t-statistic (ibmT), significance analysis of microarrays (samT) and area under the ROC curve (AUC). On both datasets all differentially expressed genes with bimodal or multimodal distributions were not selected by all standard selection procedures. We also compared our results with (i) area between ROC curve and rising area (ABCR) and (ii) the test for not proper ROC curves (TNRC). We found our methodology more comprehensive, because it detects both bimodal and multimodal distributions and different variances can be considered on both samples. Another advantage of our method is that we can analyze graphically the behavior of different kinds of differentially expressed genes. Conclusion: Our results indicate that the arrow plot represents a new flexible and useful tool for the analysis of gene expression profiles from microarrays.