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Occupational exposure to fungi in waste sorting from Canada

2021Master thesis Open access
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dc.contributor.advisorViegas, Carlapt_PT
dc.contributor.authorDias, Marta Sofia Forte
dc.date.accessioned2021-05-03T17:56:16Z
dc.date.available2021-05-03T17:56:16Z
dc.date.issued2021
dc.descriptionMestrado em Tecnologias Clínico Laboratoriaispt_PT
dc.description.abstractABSTRACT - Globally, a significant number of people deal with waste management, and microorganism contamination is seen as an occupational health issue for those who treat solid waste. Waste-related microbiological exposures may occur indoors where waste is processed, or outdoors during its processing and may be caused by the sorting, transfer or cleaning process. The aim of the study is to assess forklift drivers’ exposure by inhalation to fungi, during waste management. A total of 41 samples was used, 16 Cabin Ventilation Filters (ventilation filters from vehicle cabinets of waste management trucks) and 25 filters from air microbiological sampler Surface Air System Super (SASS). The SASS Filters and the Cabin Ventilation Filters extracts were analyzed by culture-based methods (including azole-resistance screening) and qPCR, targeting four Aspergillus sections (Fumigati, Flavi, Nidulantes, and Circumdati). To improve the selectivity for fungal growth, two different culture media were used: malt extract agar (MEA) supplemented with chloramphenicol (0.05%) and dichloran-glycerol agar (DG18). For antifungal resistance screening, samples were spread (0.15 ml) onto Sabouraud dextrose agar media supplemented with 4 mg 𝐿−1 itraconazole (ITR), 1 mg 𝐿−1 voriconazole (VOR), or 0.5 mg 𝐿−1 posaconazole (POS) (protocol adapted from the EUCAST 2017 guidelines). Aspergillus sp. presented the highest prevalence in Cabin Ventilation Filters on MEA (35.8%), while in DG18, the highest prevalence belongs to Penicillium genera (66.5%). In SASS Filters, Aspergillus sp. presented the highest prevalence on MEA (67.6%), whereas on DG18, the highest prevalence belongs to Penicillium sp. (31.1%). Thirteen of the 16 cabin ventilation filter samples (81.2%) presented fungal growth on 4 mg/L ITR, 10 out of 16 (62.5%) samples presented two additional fungal species on 1 mg/L VOR, and in 9 out of 16 (56.2%) samples was observed one additional fungal species on 0.5 mg/L POS. Among Aspergillus genus, Aspergillus sections Fumigati, Flavi, and Nidulantes presented the highest prevalence in Cabin ventilation Filters (2 out of 16; 12.5%), whereas in SASS Filters, the highest prevalence belongs to Aspergillus section Fumigati (3 out of 25; 12%). Regarding molecular tools, detected by PCR in the Cabin Ventilation Filters and in SASS Filter samples, all four sections targeted were detected. Overall, it was possible to assess fungal contamination in the matrices assessed and conclude that the use of different sampling methods such as the Cabin Ventilation Filters and the SASS Filters to assess the occupational exposure to fungi in this type of industry allowed to perform a more complete characterization of the fungal contamination. This study also reinforces the need to assess the exposure to fungal contamination in this specific occupational environment.pt_PT
dc.description.abstractRESUMO - Globalmente, um número significativo de pessoas lida com gestão de resíduos, e a contaminação por microrganismos é vista como um problema de saúde ocupacional para quem trata de resíduos sólidos. As exposições microbiológicas relacionadas aos resíduos podem ocorrer em ambientes internos, onde os resíduos são processados, ou ao ar livre, durante o processamento e podem ser causados pelo processo de separação, transferência ou limpeza. O objetivo deste estudo é avaliar a exposição inalação a fungos dos condutores de empilhadores, durante a gestão de resíduos. Foram utilizadas 41 amostras, 16 Filtros de Ventilação de Cabine (filtros de ventilação de cabines de empilhadores) e 25 filtros de amostrador microbiológico de ar Super Sistema de Ar de Superfície (SSAS). Os extratos dos filtros SSAS e dos Filtros de Ventilação da Cabine foram analisados por métodos baseados em cultura (incluindo resistência a azóis) e qPCR, visando a deteção de quatro espécies de Aspergillus (Fumigati, Flavi, Nidulantes e Circumdati). Para melhorar a seletividade para o crescimento fúngico, foram utilizados dois meios de cultura diferentes: ágar extrato de malte (MEA) suplementado com cloranfenicol (0,05%) e ágar diclorano-glicerol (DG18). Para a triagem de resistência antifúngica, as amostras foram espalhadas (0,15 ml) em meio de ágar Sabouraud dextrose suplementado com 4 mg 𝐿−1 itraconazol, 1 mg 𝐿−1 voriconazol ou 0,5 mg 𝐿−1 posaconazol (protocolo adaptado das diretrizes EUCAST 2017). Nos Filtros de Ventilação de Cabine a espécie com maior prevalência em MEA (35,8%) foi Aspergillus sp.. Em DG18, a maior prevalência pertence ao Penicillium sp. (66,5%). Nos Filtros SSAS, Aspergillus sp. apresentou a maior prevalência em MEA (67,6%), e em DG18, a maior prevalência pertence a Penicillium sp. (31,1%). Treze das 16 amostras de Filtro de Ventilação de Cabine (81,2%) apresentaram crescimento fúngico em 4 mg/L ITR, 10 de 16 amostras (62,5%) apresentaram mais duas espécies fúngicas em 1 mg / L VORI; e 9 de 16 amostras (56,2%) apresentaram mais uma espécie fúngica em 0,5 mg / L POSA. Relativamente às ferramentas moleculares, Aspergillus sections Fumigati, Flavi e Nidulantes foram as que apresentaram a maior prevalência nos Filtros de Ventilação de Cabine (2 de 16; 12,5%), enquanto nos Filtros SASS, a maior prevalência pertence à section Fumigati (3 de 25; 12%). De forma geral, foi possível concluir que o uso de diferentes métodos de amostragem como os Filtros de Ventilação de Cabine e os Filtros SSAS, para avaliar a exposição ocupacional a fungos neste tipo de indústria é um bom método, uma vez que nos permite realizar uma caracterização mais completa da contaminação fúngica. Este estudo também reforça a necessidade de avaliar a exposição à contaminação fúngica neste ambiente ocupacional especificamente.pt_PT
dc.description.versionN/Apt_PT
dc.identifier.citationDias MS. Exposição ocupacional a fungos numa traigem de resíduos no Canadá [dissertation]. Lisboa: Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboa/Instituto Politécnico de Lisboa; 2021.pt_PT
dc.identifier.tid202777022pt_PT
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10400.21/13270
dc.language.isoengpt_PT
dc.peerreviewedyespt_PT
dc.publisherInstituto Politécnico de Lisboa, Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboapt_PT
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/pt_PT
dc.subjectOccupational healthpt_PT
dc.subjectOccupational exposurept_PT
dc.subjectWaste-sorting industrypt_PT
dc.subjectRisk assessmentpt_PT
dc.subjectBioaerosolspt_PT
dc.subjectFungipt_PT
dc.subjectCanadapt_PT
dc.subjectSaúde ocupacionalpt_PT
dc.subjectExposição ocupacionalpt_PT
dc.subjectIndústria de resíduospt_PT
dc.subjectAvaliação de riscospt_PT
dc.subjectBioaerossóispt_PT
dc.subjectFungospt_PT
dc.subjectCanadápt_PT
dc.titleOccupational exposure to fungi in waste sorting from Canadapt_PT
dc.title.alternativeExposição ocupacional a fungos numa traigem de resíduos no Canadápt_PT
dc.typemaster thesis
dspace.entity.typePublication
rcaap.rightsopenAccesspt_PT
rcaap.typemasterThesispt_PT

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