Molecular characterization of cutaneous melanoma

Nunes, Maria Inês Marçal

Publication

Molecular characterization of cutaneous melanoma

2023Master thesis

dc.contributor.advisor	Pópulo, Helena Isabel	pt_PT
dc.contributor.advisor	Ferreira, Ana Paula Soares	pt_PT
dc.contributor.advisor	Ladeira, Carina	pt_PT
dc.contributor.author	Nunes, Maria Inês Marçal
dc.date.accessioned	2024-02-05T12:15:53Z
dc.date.available	2024-02-05T12:15:53Z
dc.date.issued	2023
dc.description	Mestrado em Tecnologias Clínico-Laboratoriais	pt_PT
dc.description.abstract	ABSTRACT - Cutaneous melanoma (CM) is the least frequent but deadliest kind of skin cancer, harboring one of the highest mutation rates among all malignancies. The most frequently altered genes are BRAF, NRAS, and TERT promoter. CM treatments have failed to provide good response rates and treatment resistance development is rather frequent. As a result, additional approaches to research, such as microRNA expression analysis, including miR-125a, miR-155, and miR-579, have been investigated as potential biomarkers. Therefore, we aimed to identify potential CM biomarkers by searching for a relation between the presence of CM molecular alterations with the patients' clinicopathological data. For that, DNA and RNA were extracted from FFPE tissues of primary tumors, metastases, relapses, and sentinel lymph nodes. PCR, qPCR, and Sanger sequencing techniques were performed to evaluate molecular alterations, such as the presence of mutations in the BRAF and NRAS genes and TERT promoter and evaluation of miR-125a, miR-155, and miR-579 expression levels. The obtained data demonstrated that the most frequently mutated gene was BRAF (47%), followed by TERTp (37%) and NRAS (20%), with the latter associated with a better prognosis. Regarding multiple gene mutations, TERTp and BRAF mutations often co-occur, in opposition to BRAF and NRAS mutations. No significant associations were found between miR-125a and clinicopathological or follow-up data. However, increased miR-155 was linked to better overall survival, while elevated miR-579 was associated with favorable prognostic traits, and improved progression-free survival. To conclude, NRAS mutations are associated with better CM prognosis, and miR-579 shows potential for prognosis assessment in melanoma patients.	pt_PT
dc.description.abstract	RESUMO - O melanoma cutâneo (CM) é o cancro de pele mais raro, mas altamente letal e tem das maiores taxas de mutação entre neoplasias malignas. Os genes frequentemente alterados em melanoma são BRAF, NRAS e promotor da TERT. Tratamentos para CM têm demonstrado taxas de resposta limitadas, frequentemente acompanhadas do desenvolvimento de resistência ao tratamento. Portanto, para combater esta resistência, outras abordagens de investigação, tal como a análise da expressão de microRNAs, incluindo miR-125a, miR-155 e miR-579 têm sido estudadas como potenciais biomarcadores. Assim sendo, o nosso objetivo era identificar potenciais biomarcadores de CM associando alterações moleculares de CM aos dados clínico patológicos dos pacientes. Para isso, o DNA e RNA foram extraídos de amostras de tumores primários, metástases, recidivas e gânglios linfáticos sentinela preservados em parafina (FFPE). Foram utilizadas técnicas de PCR, qPCR e sequenciação de Sanger para avaliar as alterações moleculares, tal como a presença de mutações nos genes BRAF e NRAS e promotor da TERT e a análise dos níveis de expressão dos miRNAs, miR-125a, miR-155 e miR-579. Os resultados obtidos demonstraram que o gene mais frequentemente mutado foi o BRAF (47%), seguido pelo TERTp (37%) e NRAS (20%), associado a um melhor prognóstico. Relativamente a mutações em múltiplos genes, mutações TERTp e BRAF frequentemente coocorrem, enquanto mutações BRAF e NRAS são mutuamente exclusivas. Não encontramos associações significativas entre o miR-125a e dados clínicos ou de acompanhamento. No entanto, altos níveis de miR-155 foram associados a uma melhor sobrevida, enquanto níveis elevados de miR-579 parecem estar relacionados a características prognósticas favoráveis e a uma melhoria na sobrevida livre de progressão. Resumidamente, mutações NRAS estão associadas a um melhor prognóstico no CM, e miR-579 mostra potencial como biomarcador para avaliar o risco e o prognóstico em pacientes com melanoma.	pt_PT
dc.description.version	N/A	pt_PT
dc.identifier.citation	Nunes MI. Molecular characterization of cutaneous melanoma [dissertation]. Lisboa: Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboa/Instituto Politécnico de Lisboa; 2023.	pt_PT
dc.identifier.tid	203433211
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/10400.21/17052
dc.language.iso	eng	pt_PT
dc.peerreviewed	yes	pt_PT
dc.publisher	Instituto Politécnico de Lisboa, Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboa	pt_PT
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/	pt_PT
dc.subject	Cutaneous melanoma	pt_PT
dc.subject	Genes	pt_PT
dc.subject	microRNA	pt_PT
dc.subject	Biomarkers	pt_PT
dc.subject	Prognosis	pt_PT
dc.subject	Melanoma cutâneo	pt_PT
dc.subject	Biomarcador	pt_PT
dc.subject	Prognóstico	pt_PT
dc.title	Molecular characterization of cutaneous melanoma	pt_PT
dc.type	master thesis
dspace.entity.type	Publication
rcaap.rights	restrictedAccess	pt_PT
rcaap.type	masterThesis	pt_PT
thesis.degree.name	Tecnologias Clínico-Laboratoriais