Browsing by Author "Alexandre, Tiago Francisco Rosa Domingues"
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- Discovery of infection biomarkers based on metabolomicsPublication . Alexandre, Tiago Francisco Rosa Domingues; Calado, Cecília Ribeiro da Cruz; Silvestre, Joana; Ricardo, AntónioEnquadramento e objetivos: Pacientes críticos de COVID-19 são regularmente admitidos nos cuidados intensivos com diversas complicações, necessitando de tratamentos mais invasivos. Para além disso, os pacientes estão expostos a uma ameaça iminente de infeções durante a sua estadia hospitalar. Estas infeções podem levar ao agravamento do estado de saúde do paciente, e tendo em conta o estado atual do paciente COVID-19 critico, pode ser fatal caso não seja devidamente identificada a presença de infeção e iniciado o tratamento mais adequado. Nesta tese, o foco foi dividido em dois objetivos: determinar uma metodologia capaz de identificar mais rapidamente um estado ativo de bacteremia no paciente COVID-19 critico; e identificar a tipologia de Gram da bactéria que originou a bacteremia. Métodos: Recorrendo-se ao método do espectrometria de FTIR, e testes Principal Component Analysis (PCA), Hierarchical Cluster Analysis (HCA) e Linear Discriminant analysis (PCA-LDA), para realizar analise discriminante de uma amostra com objetivo de testar o método mais eficaz na discriminação entre pacientes com bacteremia (n=48) e pacientes sem bacteremia (n=54), e entre amostras com bactéria Gram-positiva (n=28) e bactéria Gram-negativa (n=20). Resultados: Através dos testes PCA e HCA não foi possível obter uma discriminação fidedigna nem entre amostras com e sem bacteremia, nem entre bactérias Gram-positivas e Gram-Negativas. A vasta variabilidade associada a amostras biológicas pode justificar este resultado. PCA-LDA, possibilitou resultados de 75% de eficácia na discriminação entre amostras de bacteremia e sem bacteremia, e uma eficácia de 85% na discriminação entre amostras com bactérias Gram-positivas e bactérias Gram-negativas. Conclusão: Os resultados apontam para a possibilidade da utilização da análise de espetro de espetrometria FTIR como um método apelador para o diagnóstico de bacteremia e classificação do tipo de bactéria, de uma forma simples e rápida, permitindo uma gestão mais eficiente deste tipo de pacientes críticos.